Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH4Q9UIA0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms