Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms