Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNTG1Q9NSN8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms