Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL9

DMRT3, Doublesex- and mab-3-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRT3Q9NQL9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMRT3Q9NQL9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMRT3Q9NQL9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms