Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP4-3Q9BYR4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms