Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL26L1-206ENST00000521476 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL136088.1-201ENST00000531002 541 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026254.4-201ENST00000581118 454 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 Metazoa_SRP.64-201ENST00000611904 268 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003072.3-201ENST00000623456 594 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 GEMIN2-202ENST00000308317 1420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIRT4-201ENST00000202967 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms