Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms