Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms