Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMAD5Q99717 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms