Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIN3AQ96ST3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SIN3AQ96ST3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms