Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCMH1Q96GD3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms