Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTHRC1Q96CG8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms