Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS3Q969F9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms