Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSRNP3Q8WYN3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms