Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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