Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF148Q8N7C7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms