Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NME9Q86XW9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms