Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP1BQ7LBR1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms