Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms