Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ALFQ53S48 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms