Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms