Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms