Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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