Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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