Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TROQ12816 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TROQ12816 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TROQ12816 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TROQ12816 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TROQ12816 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TROQ12816 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TROQ12816 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TROQ12816 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TROQ12816 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TROQ12816 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TROQ12816 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TROQ12816 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TROQ12816 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TROQ12816 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TROQ12816 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TROQ12816 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TROQ12816 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TROQ12816 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TROQ12816 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TROQ12816 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TROQ12816 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TROQ12816 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TROQ12816 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TROQ12816 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TROQ12816 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TROQ12816 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TROQ12816 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TROQ12816 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TROQ12816 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TROQ12816 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TROQ12816 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TROQ12816 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TROQ12816 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TROQ12816 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TROQ12816 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TROQ12816 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TROQ12816 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TROQ12816 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TROQ12816 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TROQ12816 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TROQ12816 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TROQ12816 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TROQ12816 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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