Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms