Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms