Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPCQ03188 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms