Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP5P51878 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP5P51878 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP5P51878 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP5P51878 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP5P51878 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP5P51878 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP5P51878 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP5P51878 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP5P51878 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP5P51878 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP5P51878 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP5P51878 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP5P51878 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP5P51878 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP5P51878 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP5P51878 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP5P51878 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP5P51878 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP5P51878 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP5P51878 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP5P51878 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP5P51878 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP5P51878 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP5P51878 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP5P51878 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP5P51878 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms