Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSRP3P50461 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms