Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPGP40121 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms