Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP6P35125 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP6P35125 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP6P35125 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP6P35125 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP6P35125 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP6P35125 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP6P35125 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP6P35125 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP6P35125 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP6P35125 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP6P35125 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP6P35125 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP6P35125 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP6P35125 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP6P35125 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP6P35125 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP6P35125 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP6P35125 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP6P35125 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP6P35125 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP6P35125 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP6P35125 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP6P35125 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP6P35125 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP6P35125 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP6P35125 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
USP6P35125 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP6P35125 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP6P35125 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP6P35125 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP6P35125 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
USP6P35125 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP6P35125 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP6P35125 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP6P35125 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP6P35125 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6P35125 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6P35125 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6P35125 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6P35125 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6P35125 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6P35125 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6P35125 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6P35125 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6P35125 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6P35125 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6P35125 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6P35125 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6P35125 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6P35125 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6P35125 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6P35125 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6P35125 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6P35125 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP6P35125 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6P35125 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6P35125 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6P35125 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6P35125 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6P35125 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6P35125 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6P35125 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6P35125 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6P35125 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6P35125 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6P35125 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6P35125 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6P35125 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6P35125 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6P35125 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6P35125 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6P35125 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6P35125 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6P35125 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6P35125 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6P35125 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP6P35125 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP6P35125 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP6P35125 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms