Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB5P28074 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms