Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms