Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDSP20132 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDSP20132 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDSP20132 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDSP20132 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDSP20132 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDSP20132 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDSP20132 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDSP20132 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDSP20132 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SDSP20132 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDSP20132 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDSP20132 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDSP20132 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDSP20132 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDSP20132 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDSP20132 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDSP20132 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SDSP20132 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SDSP20132 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDSP20132 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDSP20132 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDSP20132 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDSP20132 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDSP20132 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDSP20132 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms