Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms