Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG2P13727 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG2P13727 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRG2P13727 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRG2P13727 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRG2P13727 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRG2P13727 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRG2P13727 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG2P13727 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms