Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBL4AP11441 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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