Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI3P10071 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI3P10071 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI3P10071 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI3P10071 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI3P10071 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI3P10071 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI3P10071 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI3P10071 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI3P10071 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI3P10071 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI3P10071 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI3P10071 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI3P10071 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI3P10071 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI3P10071 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI3P10071 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI3P10071 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI3P10071 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms