Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C6orf47O95873 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms