Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms