Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-1B6SEH8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms