Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00312Q9Y6C7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms