Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTC7AQ9ULT0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms