Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms