Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms