Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
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