Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms