Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms