Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms